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翡翠水庫淤積調查從78年開始執行，為每年例行作業，透過斷面測量再據以統計分析水庫年淤積量，以作為水庫操作運轉、集水區管理及日後辦理清淤計畫之依據。本年度(106年)水庫淤積量30.2萬立方公尺，換算年淤積速率約為水庫初期總容量千分之0.7。自73年6月水庫初期蓄水至106年底止總淤積量約為2,626.3萬立方公尺，約佔水庫初期總容量（4億600萬立方公尺）之6.47%，蓄水總容量仍保有93.53％，年平均淤積量為78.4萬立方公尺，目前翡翠水庫淤積尚屬輕微。